സെജിയാങ് പ്രവിശ്യയിലെ ബ്രൂസെല്ല അബോർട്ടസിന്റെ ആദ്യത്തെ ഹോൾ-ജീനോം അധിഷ്ഠിത ട്രെയ്‌സബിലിറ്റി വിശകലനം - മാക്രോ & മൈക്രോ-ടെസ്റ്റിൽ നിന്നുള്ള ബയോഇൻഫോർമാറ്റിക്സ് ടീം സംയുക്ത പ്രസിദ്ധീകരണത്തിന് സംഭാവന നൽകുന്നു.

—— സെജിയാങ് സിഡിസി, മാക്രോ & മൈക്രോ-ടെസ്റ്റ്, ചൈന സിഡിസി എന്നിവയുടെ സഹകരണ പഠനം, ഫ്രോണ്ടിയേഴ്‌സ് ഇൻ സെല്ലുലാർ ആൻഡ് ഇൻഫെക്ഷൻ മൈക്രോബയോളജിയിൽ പ്രസിദ്ധീകരിച്ചു.

പഠന അവലോകനം

2026 മെയ് മാസത്തിൽ, ഫ്രോണ്ടിയേഴ്‌സ് ഇൻ സെല്ലുലാർ ആൻഡ് ഇൻഫെക്ഷൻ മൈക്രോബയോളജി (JCR Q1, IF ≈ 4.6) സെജിയാങ് പ്രൊവിൻഷ്യൽ സെന്റർ ഫോർ ഡിസീസ് കൺട്രോൾ ആൻഡ് പ്രിവൻഷൻ (സെജിയാങ് സിഡിസി) നയിച്ച ഒരു പ്രബന്ധം പ്രസിദ്ധീകരിച്ചു, ബീജിംഗ് മാക്രോ & മൈക്രോ-ടെസ്റ്റ് ബയോ-ടെക് കമ്പനി ലിമിറ്റഡിലെ ബയോഇൻഫോർമാറ്റിക്സ് ടീമും നാഷണൽ ഇൻസ്റ്റിറ്റ്യൂട്ട് ഫോർ കമ്മ്യൂണിക്കബിൾ ഡിസീസ് കൺട്രോൾ ആൻഡ് പ്രിവൻഷനും (ചൈന സിഡിസി) സഹ-രചയിതാക്കളായിരുന്നു. പഠനത്തിന്റെ പേര്:
"ചൈനയിലെ ഷെജിയാങ്ങിലെ ഏഴ് ബ്രൂസെല്ല അബോർട്ടസ് സ്ട്രെയിനുകളുടെ തിരിച്ചറിയലും ഫൈലോജെനെറ്റിക് വിശകലനവും."

ചൈനയിലെ ഷെജിയാങ് പ്രവിശ്യയിലെ ബ്രൂസെല്ല അബോർട്ടസിന്റെ (ബി. അബോർട്ടസ്) ആദ്യത്തെ വ്യവസ്ഥാപിതവും പൂർണ്ണ-ജീനോം അധിഷ്ഠിതവുമായ ഫൈലോജെനെറ്റിക് ട്രെയ്‌സബിലിറ്റി വിശകലനത്തെയാണ് ഈ പഠനം പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നത്. 2015 മുതൽ 2025 വരെ ശേഖരിച്ച ഏഴ് ഐസൊലേറ്റുകളെ (ജിൻഹുവ, ക്യൂഷോ, നിങ്‌ബോ എന്നിവിടങ്ങളിൽ നിന്നുള്ള നാല് മനുഷ്യ ഉത്ഭവ ഇനങ്ങളും മൂന്ന് കന്നുകാലി ഉത്ഭവ ഇനങ്ങളും) സംഘം വിശകലനം ചെയ്തു. കിഴക്കൻ ചൈനയിലെ ഒരു വിചിത്രമായ തെക്കൻ പകർച്ചവ്യാധി പ്രദേശത്ത് ഈ "വടക്കൻ ആധിപത്യ സ്പീഷീസിന്റെ" ഉത്ഭവത്തിനും പ്രക്ഷേപണ വഴികൾക്കും ഈ കണ്ടെത്തലുകൾ ജീനോമിക് തെളിവുകൾ നൽകുന്നു.

പശ്ചാത്തലവും പ്രാധാന്യവും

ബ്രൂസെല്ല ജനുസ്സിലെ ബാക്ടീരിയകൾ മൂലമുണ്ടാകുന്ന ഒരു സൂനോട്ടിക് രോഗമാണ് ബ്രൂസെല്ലോസിസ്. ബ്രൂസെല്ല അബോർട്ടസ് പ്രധാനമായും കന്നുകാലികളെയാണ് ബാധിക്കുന്നത്, പക്ഷേ മനുഷ്യരിലും രോഗം ഉണ്ടാക്കാം. ചൈനയിൽ, ബ്രൂസെല്ലോസിസ് ഭൂമിശാസ്ത്രപരമായ വ്യത്യാസം പ്രകടമാണ്: വടക്കൻ പ്രവിശ്യകളിലാണ് ഏറ്റവും കൂടുതൽ സംഭവിക്കുന്നത് (ഉദാഹരണത്തിന്, ഇന്നർ മംഗോളിയ, ഷാൻസി, ഹെയ്‌ലോങ്ജിയാങ്). ഇതിനു വിപരീതമായി, സെജിയാങ് ഉൾപ്പെടെയുള്ള തെക്കൻ പ്രവിശ്യകളിൽ ചരിത്രപരമായി ബ്രൂസെല്ല മെലിറ്റെൻസിസ് ആധിപത്യം പുലർത്തിയിരുന്നു, ബി. അബോർട്ടസിന്റെ വളരെ കുറച്ച് കേസുകൾ മാത്രമേ റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യപ്പെട്ടിട്ടുള്ളൂ. ഈ പ്രാദേശിക അസമത്വം സെജിയാങ്ങിലെ ബി. അബോർട്ടസിന്റെ ജനിതക സ്വഭാവവും ഉറവിട കണ്ടെത്തലും ഒരു പ്രധാന പൊതുജനാരോഗ്യ മുൻഗണനയാക്കുന്നു.

രീതികളും പ്രധാന കണ്ടെത്തലുകളും

തന്മാത്രാ ജീവശാസ്ത്രവും ബയോഇൻഫോർമാറ്റിക്സും സംയോജിപ്പിച്ച് ഒരു ബഹുമുഖ തന്ത്രമാണ് ഗവേഷണ സംഘം സ്വീകരിച്ചത്:

1.രോഗകാരി തിരിച്ചറിയലും അടിസ്ഥാന ടൈപ്പിങ്ങും

BCSP-31 ജീൻ PCR ഉം AMOS-PCR ഉം ഏഴ് ഐസൊലേറ്റുകളും B. അബോർട്ടസ് ആണെന്ന് സ്ഥിരീകരിച്ചു.

ഒൻപത് ഹൗസ് കീപ്പിംഗ് ജീനുകളെ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള മൾട്ടിലോക്കസ് സീക്വൻസ് ടൈപ്പിംഗ് (MLST) എല്ലാ ഐസൊലേറ്റുകളും സീക്വൻസ് ടൈപ്പ് ST2 ൽ പെട്ടതാണെന്ന് കണ്ടെത്തി, ഇത് സെജിയാങ്ങിലെ രക്തചംക്രമണത്തിലുള്ള ബി. അബോർട്ടസ് സ്ട്രെയിനുകളിൽ ഉയർന്ന ജനിതക ഏകതയെ സൂചിപ്പിക്കുന്നു.

2.മുഴുവൻ-ജീനോം സ്വഭാവരൂപീകരണം

ഇല്ലുമിന നോവസെക് പ്ലാറ്റ്‌ഫോമിലാണ് സമ്പൂർണ്ണ ജീനോം സീക്വൻസിംഗ് നടത്തിയത്. ശരാശരി ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് ഐഡന്റിറ്റി (ANI) വിശകലനം കാണിക്കുന്നത് സെജിയാങ് ഐസൊലേറ്റുകൾ റഫറൻസ് സ്‌ട്രെയിൻ B. അബോർട്ടസ് 544 മായി 99.99% വരെ സമാനത പങ്കിട്ടിട്ടുണ്ട് എന്നാണ്.

പാൻ-ജീനോം വിശകലനം വളരെ സംരക്ഷിതമായ ഒരു ജനസംഖ്യ വെളിപ്പെടുത്തി: 3,084 കോർ ജീനുകളെ തിരിച്ചറിഞ്ഞു, കൂടാതെ 10 ഷെൽ ജീനുകൾ മാത്രമേ തിരിച്ചറിഞ്ഞുള്ളൂ, കൂടാതെ സോഫ്റ്റ് കോർ അല്ലെങ്കിൽ ക്ലൗഡ് ജീനുകൾ കണ്ടെത്തിയില്ല.

3.വൈറസിനെയും ആന്റിമൈക്രോബയൽ പ്രതിരോധത്തെയും കുറിച്ചുള്ള ജീൻ പ്രൊഫൈലുകൾ

LPS ബയോസിന്തസിസ്, T4SS സ്രവണ സംവിധാനം, BvrR-BvrS ടു-കംപോണന്റ് റെഗുലേറ്ററി സിസ്റ്റം തുടങ്ങിയ ക്ലാസിക്കൽ പാതകൾ ഉൾക്കൊള്ളുന്ന 68 വൈറസുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ഘടകങ്ങൾ പ്രവചിക്കപ്പെട്ടു. ശ്രദ്ധേയമായി, എല്ലാ ഐസൊലേറ്റുകളിലും bmaA, btaF എന്നീ അഡെസിൻ ജീനുകൾ ഇല്ലായിരുന്നു. റെസിസ്റ്റൻസ് ജീൻ വിശകലനം CARD ഡാറ്റാബേസിൽ mprF ജീൻ മാത്രമേ കണ്ടെത്തിയിട്ടുള്ളൂ, മറ്റ് പ്രതിരോധ നിർണ്ണായക ഘടകങ്ങളൊന്നും തിരിച്ചറിഞ്ഞിട്ടില്ല.

4. ഫൈലോജെനെറ്റിക് പുനർനിർമ്മാണവും ട്രാൻസ്മിഷൻ ട്രെയ്‌സിംഗും

കോർ-ജീനോം സിംഗിൾ-ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് പോളിമോർഫിസം (cgSNP) വിശകലനം സെജിയാങ് ഐസൊലേറ്റുകളെ ആഗോള ഫൈലോജെനെറ്റിക് ട്രീയിൽ ഒരു പ്രത്യേക സ്ഥാനത്ത് നിർത്തി. റഷ്യ, മംഗോളിയ, നിരവധി വടക്കൻ ചൈനീസ് പ്രവിശ്യകൾ (നിങ്‌സിയ, ഹെയ്‌ലോങ്‌ജിയാങ്, ഇന്നർ മംഗോളിയ, ഹെബെയ്, ഗാൻസു, ബീജിംഗ്) എന്നിവിടങ്ങളിൽ നിന്നുള്ള സെജിയാങ് സ്‌ട്രെയിനുകൾക്കൊപ്പം ഒരു മോണോഫൈലെറ്റിക് ഗ്രൂപ്പ് രൂപപ്പെടുന്നതായി ഫലങ്ങൾ കാണിച്ചു. ഈ ഗ്രൂപ്പ് മൂന്ന് വ്യത്യസ്ത ഉപ ക്ലേഡുകളായി (ക്ലേഡ് 1–3) വിഭജിക്കുന്നു, ഇത് ഒന്നിലധികം സ്വതന്ത്ര ആമുഖ പരിപാടികൾ നിർദ്ദേശിക്കുന്നു.

നിഗമനങ്ങളും പ്രത്യാഘാതങ്ങളും

സെജിയാങ് പ്രവിശ്യയിലെ ബി. അബോർട്ടസിന്റെ ആദ്യത്തെ ഉയർന്ന കൃത്യതയുള്ള ജീനോമിക് ഡാറ്റാസെറ്റ് ഈ പഠനം നൽകുന്നു, കൂടാതെ നിരവധി പ്രധാന നിഗമനങ്ങളിൽ എത്തിച്ചേരുന്നു:

1. ക്ലെar ജനിതക പശ്ചാത്തലം– സെജിയാങ്ങിൽ പ്രചരിക്കുന്ന ബി. അബോർട്ടസ് സ്ട്രെയിനുകൾ എസ്ടി 2 ൽ പെടുന്നു, ജനിതകപരമായി ഉയർന്ന തോതിൽ സംരക്ഷിക്കപ്പെടുന്നു, കൂടാതെ ഒരു സാധാരണ ബോവിൻ ബ്രൂസെല്ലോസിസ് വംശപരമ്പരയെ പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നു.

2. എവിക്രോസ് റീജിയണൽ ട്രാൻസ്മിഷന്റെ ഉത്ഭവം– ഷെജിയാങ്ങിൽ ഒരു സ്വതന്ത്ര പ്രാദേശിക വംശപരമ്പരയുടെ നിലനിൽപ്പിനെ ഫൈലോജെനെറ്റിക് വിശകലനം പിന്തുണയ്ക്കുന്നില്ല. പകരം, ഈ വംശങ്ങൾ വടക്കൻ ചൈനയിൽ നിന്നാണ് ഉത്ഭവിച്ചതെന്നും റഷ്യയിൽ നിന്നും മംഗോളിയയിൽ നിന്നുമുള്ള വംശപരമ്പരകളുമായി ഒരു പൊതു പരിണാമ പശ്ചാത്തലം പങ്കിടാമെന്നും ഡാറ്റ ശക്തമായി സൂചിപ്പിക്കുന്നു. മൂന്ന് ഉപവർഗ്ഗങ്ങളുടെ സാന്നിധ്യം ഒന്നിലധികം വ്യത്യസ്ത ആമുഖ സംഭവങ്ങളെ സൂചിപ്പിക്കുന്നു.

3. പൊതുജനാരോഗ്യ പ്രത്യാഘാതങ്ങൾ- ഷെജിയാങ് പോലുള്ള പരമ്പരാഗതമായി രോഗബാധിതരല്ലാത്ത പ്രദേശങ്ങളിൽ പോലും ബ്രൂസെല്ലോസിസിന് ജീനോമിക് നിരീക്ഷണത്തിന്റെ മൂല്യം ഈ കണ്ടെത്തലുകൾ അടിവരയിടുന്നു. നിലവിലെ കേസുകളുടെ എണ്ണം കുറവാണെങ്കിലും, cgSNP പോലുള്ള ഉയർന്ന റെസല്യൂഷൻ ഉപകരണങ്ങൾക്ക് ഇറക്കുമതി ചെയ്ത പകർച്ചവ്യാധികളുടെ ഉറവിടം ഫലപ്രദമായി കണ്ടെത്താനും അന്തർ പ്രവിശ്യാ കന്നുകാലി ഗതാഗതവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട വ്യാപന ശൃംഖലകളെ തടസ്സപ്പെടുത്തുന്നതിന് ശാസ്ത്രീയ തെളിവുകൾ നൽകാനും കഴിയും.

ഈ പഠനം ഷെജിയാങ് പ്രവിശ്യയിലെ ഗവേഷണ വിടവ് നികത്തുക മാത്രമല്ല, യാങ്‌സി നദി ഡെൽറ്റ മേഖലയിലെ രോഗകാരി നിരീക്ഷണത്തിനും ബ്രൂസെല്ലോസിസിന്റെ അപകടസാധ്യത വിലയിരുത്തലിനുമുള്ള പുതിയ അടിസ്ഥാന ഡാറ്റ നൽകുകയും ചെയ്യുന്നു.

പേപ്പർ വിവരങ്ങൾ:
യാങ്, വൈ., ഷി, എക്സ്., ചെൻ, ജെ., വാങ്, എൽ., വു, ഇസഡ്., യാവോ, ഡബ്ല്യു., ... & വു, ബി. (2026). ചൈനയിലെ ഷെജിയാങ്ങിൽ ഏഴ് ബ്രൂസെല്ല അബോർട്ടസ് സ്ട്രെയിനുകളുടെ തിരിച്ചറിയലും ഫൈലോജെനെറ്റിക് വിശകലനവും. ഫ്രോണ്ടിയേഴ്‌സ് ഇൻ സെല്ലുലാർ ആൻഡ് ഇൻഫെക്ഷൻ മൈക്രോബയോളജി, 16, 1758965.